Buenos días, siendo discrepar con otro compañero, pero me temo si no se hizo el certificado previo a la reforma, el certificado que se haga saldrá con la fecha de registro, que no se puede modificar.

Eso, sí, uno puede solicitar la deducción en el IRPF y no pasará nada, salvo que la Agencia Tributaria haga una inspección y entonces las fechas no cuadrarán, con lo que se perderá la deducción y se aplicará la sanción correspondiente.

Adjunto el texto de un blog de esta misma página, Certicalia, donde se expone claramente esta problemática:

¿Puedo pedir el certificado energético previo a la reforma aunque esta ya esté acabada?
No. Cuando un técnico realiza un certificado energético y lo registra se le adjudica una fecha. Puedes encontrarte con técnicos que prometan que pueden expedirte el certificado con la fecha que elijas, pero esto es falso.

En el caso de que algún técnico te convenza de que puede expedirte un certificado con fecha pasada no te valdrá para acogerte a la desgravación en el IRPF. Recuerda que cuando registre el certificado en el organismo que corresponda se le adjudicará una fecha de registro. Si Hacienda te realiza una inspección descubrirá que el certificado energético no es de una fecha pasada y deberás hacerte cargo de la multa correspondiente. En Certicalia, como expertos en eficiencia energética, te recomendamos que no te la juegues.

¿Qué puedo hacer si ya he hecho la reforma y no tengo el certificado energético previo?
Nada. Ya no puedes acogerte a la desgravación en tu renta.

Estimada Irene,
Claro que puede hacerlo si se cumplen los requisitos técnicos para ello con las mejoras. Para ello tiene que contratar a un arquitecto que le haga dos certificados energéticos, uno del antes, otro del después de las mejoras.
Muchos éxitos,