Buenos días Carmen, Se debe solventar el incumplimiento de habitabilidad (recuperar la altura necesaria) o dejar fuera esa superfície de la computable como habitable, si fuera posible. Por cosas como estas no es recomendable realizar reformas sin personal técnico. Una mala reforma puede causar perdidas de habitabilidad o de habitaciones (según reglamento).
Espero haber sido de ayuda,
Cualquier cosa puede contactar directamente con nosotros.

Si la escritura justifica que el piso es muy antiguo, en aquella época no se requería tanta altura cómo se requiere actualmente.
Hay que analizar con detalle las fechas de inscripción cómo piso con uso residencial en el registro de la propiedad (escrituras) y ver si la altura es cómo mínimo la requerida en aquella época.