Lo primero que se debería gestionar és la consulta urbanistica en el ayuntamiento para ver que normativa aplica en el inmueble. Según la clave urbanistica que tenga la zona se determina si el inmueble sólo puede ser unifamiliar o bien se permiten edificios plurifamiliares y sus carecterísticas. Una vez realizada la consulta se podrà continuar o no la división horizontal. En mi opinión primero haría consulta urbanística antes de gestionar cédulas de habitabilidad.

ante todo averiguar si es factible legalizar, las viviendas, ir a l'ayuntamiento y consultar la viabilidad, si la normativa actual lo permite o no, ademas si existe algún elemento que sea volumen disconforme o se encuentre fuera de ordenación....
si legalmente es viable, se tiene que hacer un proyecto de legalización que reconozca las nuevas entidades. esto puede acarrear a lo mejor obras de condicionamiento de la viviendas para que cumpla el decreto de habitabilidad. posteriormente tramitar la inscripción en el registro de las entidades nuevas (al ser para vender es necesario...), tramitar la inscripción en catastro. y una vez o en paralelo, solicitar la cedula de habitabilidad, y también el certificado energético...