Para facilitar la contratación de suministros (agua, luz) por separado basta con que hagas la separación sólo en catastro. Pasarías a tener una sola propiedad registral con dos referencias catastrales. Sólo si quieres registrarlo en (registro de la propiedad) como dos propiedades totalmente independientes es cuando se genera la obligación del impuesto.
Como es sólo para alquilar el local no te interesa hacer una segregación en registro pues supondría, además del posible informe de un técnico para la división horizontal, el paso por notaría con su gasto, el costo de registro y el ITPAJD, lo que elevaría el costo a varios miles de euros. Eso sólo te compensa si aspiras a vender el local y conservar la vivienda en propiedad.
Para avanzar en estas gestiones estamos a tu disposición.