¿Puede quedar tapado el perfil de pvc del cerramiento de la galería por el suelo de la cocina?

He cerrado una galería añadiendo el espacio a la cocina. El problema es que al tomar las medidas no contemplaron el desnivel entre el suelo del interior y el suelo añadido . Ahora el perfil del cerramiento, al subir el nivel del suelo, queda prácticamente tapado. ¿Puede esto generarme problemas?